I vid bemärkelse är Shinjuku en av de tjugotre avdelningarna i Tokyo. Namnet hänvisar dock också till ett av Tokyo stadscentrum, som ligger runt statens järnvägsstation och de tre åtkomststationerna. Den första stationen byggdes här i slutet av 1800-talet och det blev ett viktigt kommunikationscentrum nästan omedelbart. På grund av utvecklingen av järnvägen växte Shinjuku snabbt och blev en av de mest livfulla delarna av staden. Tillväxtprocessen tog bara ett sekel. Idag är Shinjuku Station ett stort komplex som är världens mest trafikerade nav. Det finns också fyra av de tio högsta Tokyo-byggnaderna i grannskapet.
