У Ліоні, великому місті, розташованому в центрально-східній Франції, до Академії належать три університети. Найстарішим з них є Université Lumière Lyon 2, Université Claude Bernard Lyon 1 спеціалізується на природничих науках та медицині, а Université Jean Moulin Lyon 3, заснований у 1973 році, пропонує навчання на таких факультетах, як школа права, філософія, література та іноземна мови. Деякі з престижних навчальних корпусів були зведені на березі річки Рони, біля Університетського мосту.
